ケント・E・ホルジンガーがウェブ上で公表している集団遺伝学テキストから抜粋。(この章で、アリゾナ大学のハマー教授が、日本人2重構造説の論文で使用したΦst遺伝距離の正確な解説がある)
where Hi is the average heterozygosity in individuals and Ht is the expected panmictic heterozygosity.
Defining Hs as the average panmictic heterozygosity within populations
In short, another way to think about Fst is
Fst =(Ht − Hs) / Ht
.
続いて、実例として、mtDNAのハプロタイプ分析を挙げているが、現在では意義が薄れているのでメモ省略する